Проверката срещу министърката бе назначена след подаден сигнал, че Караджова е  възложила на бившия си работодател Ботю Табаков и неговата фирма Е.К. ООД да разработи промени в Закона за управление на отпадъците, за които той е получил 82 хиляди лв. без ДДС. Освен това тя е взела сина му на работа като експерт в министерството. Друга фирма на Табаков пък е сключила договор без обществена поръчка за 209 хил. лв. за изграждане на система за интегрирано управление на отпадъците в региона на Ямбол, се казва в сигнала.

В случая заподозряна в конфликт на интереси е шефката на предприятието за управление на отпадъци ПУДООС Г. Симеонова, която е била общински съветник в Ямбол. Министър Караджова е отрекла да е била в каквито и да е правоотношения с Табаков. Пред комисията тя обяснила, че синът му е спечелил назначението си с конкурс. 

Конфликт на интереси не е открит и по отношение на Симеонова. Договорът за отпадъците в Ямбол е подписан в началото на 2009 г. между МОСВ и кмета на общината. Община Ямбол е избрала изпълнителя след обществена поръчка. След като комисията оневини официално Нона Караджова, депутати от мнозинството коментираха, че е "странно как сериозен орган като нея е подхванал явно подхвърлен компромат срещу екоминистъра".