Президентът Барак Обама предложи Джеймс Коми за директор на ФБР през юни 2013 г. Кандидатурата му беше одобрена от Сената с огромно мнозинство на 29 юли същата година. Коми встъпи в длъжност на 4 септември 2013 г. Той замени на този пост Робърт Мълър, който оглавяваше ведомството в продължение на 12 години.

Преди да бъде назначен на отговорния пост Коми е бил федерален прокурор в Ню Йорк, а след това заместник на главния прокурор на САЩ. През 2004 г. той се прочу, след като отказа искането на администрацията на Джордж Буш младши /2001-2009/ да възобнови програмата за следене на телефоните и електронните пощи на гражданите без санкция на съда. На следващата година той напуска своя пост като заместник на главния прокурор и започва частна юридическа практика.

От 2005 до 2010 г. Коми е бил старши вицепрезидент на корпорацията "Локхийд Мартин". От началото на 2013 е бил старши изследовател в Юридическото училище на Колумбийския университет и член на борда на директорите на банка HSBC.